primer5完美破解版_primer5破解版(在线设计引物) v5.0下载
primer5是一款由加拿大Premier公司推出的引物设计应用软件,知识兔可以方便专业的人员进行PCR、测序引物、杂交探针的设计操作,集合了分为序列编辑窗口(genetank)、引物设计窗口(primer design)、酶切分析窗口(restriction sites)和纹基分析窗口(motif)、引物设计窗口、序列编辑窗口等,知识兔可以方便用户快速得出引物分析的结果。此外,软件还可以针对模板dna的来源以相应的遗传密码规则转换dna 和氨基酸序列,它有优秀的引物自动搜索功能,同时可进行部分指标的分析,而且知识兔容易使用,已被引物设计行业人士认为是一款相当不错的软件。知识兔分享primer5破解版,且附上了软件的注册程序,免费激活开启所有功能,如果知识兔你也需要它的帮助,那就快来下载收藏吧。
软件功能介绍
1、软件的主要功能分四种,即引物设计、限制性内切酶位点分析、DNA 基元(motif)查找和同源性分析功能。前三种为其主要功能。此外,该软件还有一些特殊功能,其中最重要的是设计简并引物,另外还有序列”朗读”、DNA 与蛋白序列的互换、语音提示键盘输入等等。
2、还可以针对模板DNA 的来源以相应的遗传密码规则转换DNA 和氨基酸序列。软件共给出八种生物亚结构的不同遗传密码规则供用户选择,有纤毛虫大核(Ciliate Macronuclear)、无脊椎动物线粒体(Invertebrate Mitochondrion)、支原体(Mycoplasma)、植物线粒体(Plant Mitochondrion)、原生动物线粒体(Protozoan Mitochondrion)、一般标准(Standard)、脊椎动物线粒体(Vertebrate Mito-chondrion)和酵母线粒体(Yeast Mitochondrion)。
primer5破解版安装激活教程
1、在知识兔下载primer5软件压缩包,将其解压后找到软件的文件夹,然后知识兔打开运行程序
2、打开软件后按照下图步骤,记录下id所指的数字
3、回到所解压出大文件中,双击启动注册机程序
4、输入刚才primer5中所给的数字,知识兔点击获取激活码
5、知识兔将获取的激活码,输入到程序的“Activation Key”中,然后知识兔点击“ok”
6、下图即是完成激活了,就可以开启primer5所用功能的使用了。
软件使用帮助
一、限制性酶切点分析及基元查找功能
1、其主要功能在主界面上一目了然。限制性酶切点分析及基元查找功能比较简单,知识兔点击该功能按钮后,知识兔选择相应的限制性内切酶或基元(如-10 序列,-35 序列等),按确定即可
2、常见的限制性内切酶和基元一般都可以找到,你还可以编辑或者添加新限制性内切酶或基元
二、引物设计
1、打开DNA序列后点击按钮primer,出现“search criteria”窗口,有多种参数可以调整
2、搜索目的(Seach For)有三种选项,PCR 引物(PCR Primers)、测序引物(Sequencing Primers)和杂交探针(Hybridization Probes)
3、搜索类型(Search Type)可选择分别或同时查找上、下游引物(Sense/Anti-sense Primer,或Both),或者成对查找(Pairs),或者分别以适合上、下游引物为主(Compatible with Sense/Anti-sense Primer)。另外还可改变选择区域(Search Ranges),引物长度(Primer Length),知识兔选择方式(Search Mode),参数选择(Search Parameters)等等
4、使用者可根据自己的需要设定各项参数。如果知识兔没有特殊要求,知识兔建议使用默认设置。然后知识兔按search,随之出现的Search Progress 窗口中显示Search Completed 时,再按OK,这时搜索结果以表格的形式出现,有三种显示方式,上游引物(Sense),下游引物(Anti-sense),成对显示(Pairs)。默认显示为成对方式,并按优劣次序(Rating)排列,满分为100,即各指标基本都能达标
三、引物点击
1、知识兔点击其中一对引物,如第1#引物,并把上述窗口挪开或退出,显示“Peimer Premier”主窗口,所得结果分三部分,
2、模板及产物位置,中间是所选的上下游引物的一些性质,最下面是四种重要指标的分析,包括发夹结构(Hairpin),二聚体(Dimer),错误引发情况(False Priming),及上下游引物之间二聚体形成情况(Cross Dimer)
3、当所分析的引物有这四种结构的形成可能时,按钮由变成,知识兔点击该按钮,在左下角的窗口中就会出现该结构的形成情况
4、一对理想的引物应当不存在任何一种上述结构,因此最好的情况是最下面的分析栏没有,只有。值得注意的是中间一栏的末尾给出该引物的最佳退火温度
四、引物修饰编辑
1、在需要对引物进行修饰编辑时,如在5’端加入酶切位点,可点击,然后知识兔修改引物序列
2、若要回到搜索结果中,则点击按钮。如果知识兔要设计简并引物,只需根据源氨基酸序列的物种来源选择前述的八种遗传密码规则,反推至DNA 序列即可
3、对简并引物的分析不需像一般引物那样严格
4、总之,“Premier”有优秀的引物自动搜索功能,同时可进行部分指标的分析,而且知识兔容易使用,是一个相当不错的软件
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