[Win] Molsoft ICM-Pro 蛋白质结构建模分析软件下载

软件下载 12月 10, 2023 0 king

软件介绍

Molsoft ICM-Pro 是 Windows 上一款通过分享高质量的蛋白质结构分析、建模和对接桌面软件环境，为生物学家或化学家分享支持。您可以直接访问序列和结构数据库，该数据库允许您：分析序列和比对，检查蛋白质结构，研究口袋和结合的配体和药物，创建表面，计算静电，进行突变，预测配体结合位点，预测蛋白质 – 蛋白质相互作用位点，执行小分子和蛋白质 – 蛋白质对接以及使用交互式配体编辑器设计配体。

ICM-Pro 分享与蛋白质数据库（PDB）的直接链接。下载结构后，您可以分析结构 – 构建拉马钱德兰图，叠加多个结构，分析距离和角度，计算接触和表面积，显示氢键，构建静电表面并计算配体结合口袋。
ICM 袖珍查找器是一种识别任何蛋白质，DNA或RNA结构中的配体结合位点的方法。根据受体范德华相互作用的网格电位图鉴定蛋白质 – 配体结合位点，并且知识兔表面轮廓化。然后知识兔计算口袋的物理性质并制成表格，并分享药物相似性评分。
交互式编辑受体结合袋内的化学物质。修改原子和基团，并查看变化对配体结合能和分数的影响。重新对接并最小化配体。
了解蛋白质结构的关键是全面评估PDB文件中包含的底层晶体学信息。例如，重要的是要了解蛋白质的完整生物学单位，以确定晶体 – 晶体接触是否影响了结构，或者您可能想要勾勒电子密度，以查看晶体学家在活性位点看到了多少配体。
ICM-Pro 为蛋白质/配体相互作用的建模分享了一套独特的工具。 ICM-Pro可快速准确地将完全连续的柔性小分子配体与网格相互作用电位表示的蛋白质对接。还有一些内置程序来解释诱导拟合包括多受体对接（4D 对接）和显式受体对接。
ICM-Pro 包含经过充分验证且成功的蛋白质-蛋白质对接算法。ICM-Pro在全球CAPRI蛋白质-蛋白质对接竞赛中一直表现出色。ICM-Pro也包含用于预测蛋白质-蛋白质对接相互作用位点的算法。
普罗塔克建模自动准确地模拟靶蛋白-PROTAC分子-连接酶的三方复合物。
ICM-Pro 在蛋白质建模方面有着良好的记录。有一些程序将规范或建立骨干，动摇全球能源的侧链和循环优化。您还可以执行小肽折叠的模拟。
预测突变的影响预测突变对蛋白质稳定性和蛋白质-蛋白质、蛋白质-肽和蛋白质-配体结合的影响。
ICM-Pro 软件包包含 ICM-Bio 中的所有工具，允许您使用高质量的全局成对和多种比对算法搜索序列数据库，并执行模式，原型和谱图搜索。多序列比对速度快，算法生成进化树、主成分视图、从序列到结构的注释转移，螺纹和对齐可视化工具。
任何大小的分子的泊松方程可以是使用不依赖于任何网格的边界元算法高效求解，并使用精确的分析分子表面作为边界。ICM-REBEL使用边界计算分子的精确静电势元素算法并生成按电位着色的 3D 表面皮肤模型。求解具有电荷精确位置的分子的泊松方程。
有多种化学工具可用。化学品可以草绘并在ICM分子编辑器中查看，并在化学电子表格中查看。
ICM-Pro 包含 ICM-Browser-Pro 中的所有工具，这是完整而强大的图形工具阵列，都可以从 GUI 界面访问。用线、CPK、球棒、蠕虫、带状、可触及表面、透明分子表面、透视、深度提示、光滑坚固的固体表面。同时使用硬件、并排和浮雕立体声。