MEGA7.0生物软件下载|MEGA进化树 V7.0.26 免费版下载

MEGA进化树是来自国外的一款操作便捷,功能强大的分子进化遗传分析软件,软件功能齐全,界面简单直观,新版本带来了更多的功能和改善,增加了了向导式系统,知识兔用于识别树中的基因复制事件,并且知识兔重新考虑树资源管理器,知识兔以便可以显示多达100k类群的树。

MEGA进化树

【功能特点】

1、【序列分析】

系统发育推论

型号选择

约会和时钟

祖传国家

选择和测试

序列比对

2、【统计方法】

最大似然

距离方法

普通最小二乘

最大的简约

复合似然

贝叶斯

3、【强大的视觉工具】

对齐/跟踪编辑器

树探索者

数据探索者

传奇发电机

基因复制向导

时间树向导

MEGA进化树

【使用教程】

1、首先根据提示安装好软件之后,准备需要建树的序列,并将序列保存为fasta格式。

2、打开MEGA7,知识兔点击Align–Edit/built Alignment,知识兔选择Create a new alignment,知识兔点击ok。

3、打开刚刚保存下来的fasta序列。

4、知识兔点击Alignment –Align by ClustalW ,知识兔选择所有序列,出现下图,参数根据需求修改,在这我们就直接选择默认,知识兔点击ok。

5、比对完成后,知识兔点击Data –Phylogenetic Analysis,出现下图坐标箭头指向的两个按钮。

6、知识兔点击Phylogeny,有5个构建进化树的方法,一般选择MaximumLikehood(最大似然法)、Neighbor-Joining(邻接法)和Minimum-Evolution(最小进化法)方法,在此选择选择Neighbor-Joining(邻接法)建树。

7、在Test of Phylogeny 选择Bootstrapmethod; No.ofBootstrap replications 输入2000; Mode/Method 核酸选择Maximum Composite Likehood, 氨基酸序列选择Poisson model; Rates among sites 选择Uniform rates; Gaps/Missing Data Treatment 选择Compeledeletion, 知识兔点击Compute得到下面结果,知识兔根据自己的需求对树进行修饰。

下载仅供下载体验和测试学习,不得商用和正当使用。

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